337 पेपर
रिमोट होमोलॉजी डिटेक्शन, अल्फाफोल्ड स्ट्रक्चरल मॉडलिंग और फंक्शनल जेनेटिक्स को एकीकृत करके, यह अध्ययन प्रकट करता है कि Scm3/HJURP ऑर्थोलॉग्स तीव्र अनुक्रम विचलन (sequence divergence) के बावजूद मेटाज़ोअन्स में सार्वभौमिक रूप से संरक्षित हैं, जो इस पिछली धारणा को उलट देता है कि वे कीटों, नेमाटोड्स और कई कशेरुकी जीवों में अनुपस्थित थे।
यह शोधपत्र एकीकृत पारिस्थितिक-विकासवादी गतिशीलता (eco-evolutionary dynamics) को मॉडल करने के लिए माप-मानित प्रक्रियाओं (measure-valued processes) पर आधारित एक नवीन स्टोकेस्टिक ढांचे को प्रस्तुत करता है, जो यह प्रकट करता है कि जेनेटिक ड्रिफ्ट (genetic drift) आनुवंशिक सहसंबंधों को चरम सीमाओं तक धकेलकर G-मैट्रिक्स के ओरिएंटेशन को मौलिक रूप से बदल देता है, एक ऐसा निष्कर्ष जो पारंपरिक धारणाओं को चुनौती देता है और अनुभवजन्य अवलोकनों के अनुरूप है।
यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि दो अभिसारी ऑस्ट्रलेशियन गेको विकिरणों (radiations) में, अजैविक कारक मुख्य रूप से एलोपैट्री (allopatry) में फेनोटाइपिक विचलन को संचालित करते हैं, जबकि प्रतिस्पर्धी अपवर्जन (competitive exclusion) बाद में सिम्पैट्री (sympatry) में प्रजातियों के ओवरलैप को आकार देता है।
यह अध्ययन प्रकट करता है कि *Schizosaccharomyces pombe* आइसोलेट्स में गैलेक्टोज और मेलिबोज़ चयापचय में प्राकृतिक भिन्नता विपरीत विकासवादी बलों के एक गतिशील अंतर्संबंध द्वारा आकार लेती है, जिसमें जीन की हानि, दमन, प्रवर्धन और क्षैतिज जीन स्थानांतरण शामिल हैं, जो यह प्रदर्शित करता है कि एक एकल यूकेरियोटिक प्रजाति चयापचय विविधता प्राप्त करने के लिए रेडक्टिव (घटते हुए) और एक्सपेंसिव (विस्तारवादी) दोनों विकासवादी पथों को एक साथ अपना सकती है।
SplitAligner एक नवीन ढांचा है जो प्रजाति-वृक्ष (species-tree) की शाखाओं को जीन-विशिष्ट टैक्सोन सेटों पर प्रक्षेपित करके जीन और प्रजाति वृक्षों के बीच सामंजस्य स्थापित करता है ताकि संरचनात्मक अनुपलब्धता (structural missingness) और टोपोलॉजी-प्रेरित विसंगति (topology-induced discordance) के बीच व्यवस्थित रूप से अंतर किया जा सके, जिससे हजारों लोकी (loci) में मानकीकृत शाखा-वार विकासवादी विश्लेषण सक्षम हो सके।
यह अध्ययन चेटोग्नाथ *Spadella cephaloptera* में प्रारंभिक न्यूरोजेनेसिस (तंत्रिकाजनन) का एक व्यापक अभिव्यक्ति-आधारित विकासात्मक मानचित्र स्थापित करता है, जो यह प्रकट करता है कि इसकी अद्वितीय तंत्रिका तंत्र संरचना के बावजूद, यह संरक्षित द्विपक्षीय (बाइलेटरियन) आणविक पैटर्न वाली विशेषताओं और प्रमुख न्यूरोजेनिक एवं अक्षीय जीनों के स्थानिक-कालिक परिनियोजन को प्रदर्शित करता है।
यह शोध पत्र एक व्यापक, सार्वजनिक रूप से सुलभ जीनोमिक डेटाबेस प्रस्तुत करता है जिसमें आउटक्रॉसिंग *Arabidopsis lyrata* और *A. arenata* के 1,700 से अधिक अनुक्रमित जीनोम शामिल हैं जो स्थानीय अनुकूलन और तुलनात्मक आनुवंशिकी पर अनुसंधान को सुगम बनाने के लिए जनसंख्या संरचना, भौगोलिक मानचित्रण और जीनोम-व्यापी एसोसिएशन अध्ययन क्षमताओं को एकीकृत करता है।
यह शोध पत्र **scoup** को प्रस्तुत करता है, जो एक R-आधारित बायोकंडक्टर टूल है जो डार्विनियन चयन के तहत कोडन अनुक्रमों को सिम्युलेट करने के लिए हालपर्न-ब्रूनो उत्परिवर्तन-चयन मॉडल और ऑर्नस्टीन-उलेंबैक प्रक्रिया के एक नवीन संलयन के माध्यम से फाइलोजेनेटिक्स और जनसंख्या आनुवंशिकी को विशिष्ट रूप से जोड़ता है।
यह जीनोमिक जांच प्रकट करती है कि *Clonostachys rosea* में पूर्वज हेटरोथैलिक (heterothallic) और व्युत्पन्न होमोथैलिक (homothallic) दोनों वंश शामिल हैं, जिनमें से बाद वाले की उत्पत्ति दक्षिण अमेरिका में हुई है और वे न्यूक्लियोटाइड विविधता एवं लिंकेज डिसइक्विलिब्रियम (linkage disequilibrium) के विशिष्ट पैटर्न प्रदर्शित करते हैं जो उनकी स्व-निषेचन प्रजनन रणनीति को दर्शाते हैं।
एक अत्यधिक प्रतिकृति वाले *ड्रोसोफिला* प्रयोगात्मक विकास प्रणाली का उपयोग करते हुए, यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि विलंबित प्रजनन के लिए चयन उन अभिसारी, बहुजीनी अनुकूलनों को प्रेरित करता है जो मुख्य रूप से कैनोनिकल एजिंग पाथवे के बजाय तंत्रिका विकास और आकारजनन (मॉर्फोजेनेसिस) से जुड़े जीन में एलील आवृत्ति बदलावों के माध्यम से जीवनकाल को बढ़ाते हैं और प्रतिरक्षा रक्षा को सुदृढ़ करते हैं।